R/codon table.R

#'  Codon_table
#'
#' @param codon_table shows to which amino acid each codon will be translated to .
#'
#' @return
#' @export
#' @source \url{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?chapter=tgencodes#SG1}
"codon_table"

codon_table<-c("UUU" = "F", "UCU" = "S", "UAU" = "Y", "UGU" = "C",
  "UUC" = "F", "UCC" = "S", "UAC" = "Y", "UGC" = "C",
  "UUA" = "L", "UCA" = "S", "UAA" = "_", "UGA" = "_",
  "UUG" = "L", "UCG" = "S", "UAG" = "_", "UGG" = "W",
  "CUU" = "L", "CCU" = "P", "CAU" = "H", "CGU" = "R",
  "CUC" = "L", "CCC" = "P", "CAC" = "H", "CGC" = "R",
  "CUA" = "L", "CCA" = "P", "CAA" = "Q", "CGA" = "R",
  "CUG" = "L", "CCG" = "P", "CAG" = "Q", "CGG" = "R",
  "AUU" = "I", "ACU" = "T", "AAU" = "N", "AGU" = "S",
  "AUC" = "I", "ACC" = "T", "AAC" = "N", "AGC" = "S",
  "AUA" = "I", "ACA" = "T", "AAA" = "K", "AGA" = "R",
  "AUG" = "M", "ACG" = "T", "AAG" = "K", "AGG" = "R",
  "GUU" = "V", "GCU" = "A", "GAU" = "D", "GGU" = "G",
  "GUC" = "V", "GCC" = "A", "GAC" = "D", "GGC" = "G",
  "GUA" = "V", "GCA" = "A", "GAA" = "E", "GGA" = "G",
  "GUG" = "V", "GCG" = "A", "GAG" = "E", "GGG" = "G")
rforbiodatascience22/group_18_package documentation built on April 5, 2022, 7:51 p.m.